Zusätzlich zu den 50 fest angestellten Mitarbeitenden, welche 34 Vollzeitstellen entsprechen, arbeiten im Naturhistorischen Museum Basel 20 Projektmitarbeitende und 30 Ehrenamtliche. Insgesamt sind über 100 Mitarbeitende im Naturhistorischen Museum Basel beschäftigt.
Neben den beiden wissenschaftlichen Abteilungen arbeiten die Mitarbeitenden der Werkstätten und Präparatorien sowie die Hauswarte Hand in Hand, um das ganze Haus in Betrieb zu halten. Für Ausstellungsprojekte arbeiten die Teams aus verschiedenen Berufen gemeinsam zusammen, um die Ausstellung zur richtigen Zeit fertig zu stellen. Speziell zu erwähnen sind die ehrenamtlichen Mitarbeitenden, die für das Museum unbezahlbare Arbeit im wahrsten Sinne des Wortes leisten. Sie ermöglichen zum Beispiel wissenschaftliche Untersuchungen an Sammlungen und deren Publikationen, die sonst aus Kapazitätsgründen nicht durchgeführt werden könnten.
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